「機動戰士高達SEED」以「21世紀的首部高達作品」為概念，從2002年起在電視上播放。本作品本著成為新標準的目標，透過充滿魅力的角色和華麗的影像，除了過往的高達迷外，亦獲得了不少狂熱的新擁躉，成為了大受歡迎的人氣之作。

宇宙紀元——這是一個透過操作遺傳因子而誕生的「調整者」在宇宙活躍的時代。本來充滿著夢想和希望的未來，卻由於被稱為「血色情人節」的事件而煙消雲散。地球聯合和布蘭度的抗爭浮面，演變成全面戰爭。而在開戰後11個月……戰況陷入了僵局。扎多軍侵入中立殖民星進行高達奪取作戰，波及到了主角基拉‧大和，致使他無可避免地被捲入至戰火之中。駕駛最新型機動戰士突擊高達的基拉，會看到怎樣的戰場？